内蒙古河套灌区管理总局,该局承担五项职能,负责总排干沟全长,干沟尾部扬水站,红圪卜排水泵站及乌毛计闸,挡黄闸等水利设施的运行和维护管理工作,负责灌区的农业排水,山前排洪及城乡生活,工业达标废水排放工作,负责排水系统的水质监测和保护工作,负责制定排水,污水处理,中水回用和再生水利用计划,监控污水排放和水质,指导协调全市排水工作河套灌区排水事业管理局隶属于内蒙古河套灌区管理总局,属公益性事业单位,正处级建制,内设9个科室,下设7个基层所站。该局的前身为内蒙古河套灌区总排干沟管理局,2008年3月,经市政府巴政办发〔2008〕19号文批准后更名。