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医院先后荣获自治区级 “文明单位 ”、 “卫生系统思想__工作先进单位 ”等荣誉称号，自治州级 “诚信计量自我承诺示范单位 ”、 “五个好基层党组织 ”、 “普法依法治理先进单位 ”、 “下乡驻村工作先进单位 ”、 “五一巾帼先进集体 ” “平安医院 ”等荣誉称号。
医院占地37.8亩，建筑面积35235㎡。编制床位550张，昌吉州中医医院，http://www.cjzzyy.com，人员编制数442人，现有职工733人。开设针灸科、康复科、骨伤科、眼科等临床科室21个，医技科室12个，行政职能后勤科室17个。有国家中医药管理局重点专科建设项目2个，国家中医药管理局重点专科培育项目1个，自治区中医民族医专科建设项目1个，院内中药制剂品种31个。
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