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医院医疗设备由医疗设备管理委员会和设备科管理。委员会由分管领导、工程技术人员、各主要科室负责人组成，负责健全采购制度，遵循 “技术上先进、功能上适用、经济上合理和有效 ”的原则，既考虑医院人才状况、规模、条件及专科发展方向，云南省中医医院官网又考虑资金来源、安装房屋、技术力量等情况；既认真调查研究，对医疗设备的社会效益和经济效益进行评估，又对医疗设备的先进性与可靠性、配套性与灵活性进行认真分析论证，根据医院的需要购置使用效率高、投资回收快、及科研攻关项目的急需设备；根据医院财力状况购置投入产出比、云南中医医院▲性能价格比高的使用设备；以现有的使用、维修及管理人才状况为标准，使购入设备 “物有所值，物尽其用 ”。设备科下辖维修室、计算机中心和远程会诊中心，负责贯彻落实医院相关决议，按规定实行政府采购和执行云南省级医院集中招标采购结果，通过最大限度的竞争，获取资金的节约和采购效益的最大化，提高采购透明度，促进廉政建设，而且有利于患者的切身利益，同时也有利于厂商的持续发展。
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云南省中医医院是全国建设历史较长的省级中医医院之一，为大型综合性三级甲等中医医院，是云南省和昆明市城镇职工和城镇居民的医疗保险的定点医疗机构和医疗保险转诊的定点医疗机构，从2009年1月起，成为全云南省第一批新农合定点医疗机构之一。
