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近年来，医院先后荣获 “全国卫生系统先进集体 ” “全国卫生系统行风建设先进单位 ” “中医药科技管理工作先进集体 ” “全国首届中医护理先进集体 ” “全国医院（卫生）文化建设先进单位 ”（4次） “全国卫生系统思想__工作先进单位 ”；2010年医院被国家中医药管理局评为 “全国中医医院总务后勤管理工作先进集体 ”称号。2005年和2008年，连续两次荣获 “全国文明单位 ”称号。2003年，医院在全疆三级甲等医院中率先通过了ISO9001：2000质量管理体系认证。
医院坚持 “以患者为关注焦点，以员工为中心，以中医药为本，永续创新 ”的发展理念和 “始于患者之需求，止于患者之满足 ”的服务宗旨，充分发挥中医药特色优势，新疆维吾尔自治区中医医院官网努力解决群众看病难、看病贵问题，初步实现了患者满意、员工爱戴、同行认同、社会推崇的目标。
医院中（维）西医结合临床和中医骨伤科学为国家级中医重点学科，心血管科、骨伤科、内分泌科及皮肤科银屑病，新疆维吾尔中医医院▲为国家级重点专科专病；急诊中心为国家级中西医结合急诊建设基地；肛肠科、肺病科、心病科、皮肤科、内分泌科、肾病科、脾胃病科、脑病科、__科、针灸科为自治区重点学科；中医特色康复专科、中西医结合肾病专科、针灸专科、中风专病、耳鸣耳聋专病为自治区重点专科（专病）。新疆维吾尔自治区中医医院官网，消化科、肝病科、皮肤科、妇科、肛肠科等科室的中医药特色享誉全疆，数十种特色中药制剂深受患者信赖；医院汇集了国内疆内有影响的名老中医及中青年专家，有享受国务院特殊津贴中医内科专家金洪元、中西医结合专家沈宝藩、中西医结合专家火树华、中医内科专家乐德行、中医内科专家安冬青、皮肤病专家刘红霞、心脏病专家许力舒、骨伤科专家项泽文等众多博士和专家，学科带头人，充分发挥传统医学与现代科技相结合的优势，走名医、名科、名院的 “三名 ”发展战略之路，充分发挥中医和中药的优势，形成了 “院有专科，新疆维吾尔中医医院▲，科有专家，专家有专病，专病有专药、专方 ”的局面。
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新疆维吾尔自治区中医医院暨新疆医科大学附属中医医院成立于1959年7月1日。1986年4 月，医院成为新疆中医学院附属医院；1998年9月，医院成为新疆医科大学附属中医医院。2001年11月，医院与新疆维吾尔自治区中医研究所合并。五十年的积淀，尤其是近十年来的快速发展，医院已成为集医疗、教学、科研、预防保健和康复于一体的大型现代化三级甲等中医医院。医院还是国家中医临床研究基地、国家中医药国际合作基地、国家药物临床试验机构、卫生部关节镜诊疗技术培训基地、专业学位临床医学博士培养单位，并设有国家级博士后科研工作站。医院同时承担着副省级以上领导及重要外宾的保健、诊疗任务。
