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中国气象局广州热带海洋气象所下设办公室、热带海洋气象研究室、边界层探测技术和应用研究室、热带气象预报技术研究室、热带气象信息与应用研究室。主办的刊物有核心刊物《热带气象学报》（中英文版）和《热带气象通讯》。
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中国气象局广州热带海洋气象研究所前身是1976年成立的广东省热带海洋气象研究所, 2001年经国家科技部、财政部、中央编制办公室批准转为国家非营利性科研机构，人员编制50人。目前固定科研人员27人，其中博士4人，在读博士5人，硕士学位15人，研究员5人，副研究员13人，科研人员平均年龄35岁。其余为客座科研人员。
