2001年10月两校合并，为医科教育的发展树立起新的里程碑，开创了更为广阔的发展前景并已取得显著成绩。2010年11月，中山大学医科成为教育部、卫生部首批 “两部共建医学院 ”。广州北校区是中山大学医科的主要集中地。
随着我校医学教育事业的发展，以及社会各界和校友的大力支持，一部分有着重要意义和功能的建筑相继建成。中山大学北校区，http://www.gzsums.edu.cn，北校区校友会堂由原中山医科大学五七届校友倡议，并由校友会发动海内外校友、企事业单位和社会人士捐资在大礼堂原址重建，于1990年10月竣工投入使用，用作举行如开学典礼、毕业典礼、实习动员大会、晚会等大型活动之用。何母刘太夫人实验楼是1992年由何善衡先生捐资兴建，1995年竣工，楼高21层，建有中山大学基础医学实验教学中心及各种实验室，用作医学基础教学及科研之用。中山大学北校区医学科技综合楼位于校区东南角，于2008年竣工，楼高15层，建筑面积为3.8万平方米，分东、西、北翼，建有中山大学临床技能中心、中山医学院各教研室、部分教学实验室及科研实验室。
医学图书馆前楼是一座具有欧洲古典主义建筑风格的建筑物。始建于1916年，1918年竣工，用作当时的医学院校舍，1953年用作图书馆一直至今。该建筑在__战争期间曾被侵华日军作为细菌战广州大本营，现已被列为广州市爱国主义教育基地、广州市文物保护单位、广州市古典建筑及历史纪念建筑物。
北校区以医科教学、科研为主，驻校区的单位有医学部，中山医学院、公共卫生学院、光华口腔医学院、护理学院，学校部处、直属单位等的部分延伸机构以及实验动物中心、中山大学北校区，http://www.gzsums.edu.cn，医学图书馆、医学档案馆等。目前在北校区学习生活的学生共五千余人，主要是上述医科学院的二年级以上本科生、硕士生、博士生，还有各附属医院的部分研究生和进修生。校区内设有北校区办公楼、教学科研区、学生生活区、教工生活区等。 中山大学北校区历史悠久，分布着不少具有历史价值的文物建筑。
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