中心推行事业单位人事制度改革，实行事业单位企业化管理，中心现有人数62人,其中在编人员9人，非编人员53人。中心设置9个职能部门，分别为：行政人事部(政策研究与发展部)、规划财务部(社会保障部)、考评部、人才服务部、人才培训一部、人才培训二部(出国人员培训中心)、人才派遣部、人才交流部、洗涤分中心。
重庆市卫生服务中心于2001年4月17日正式挂牌成立，与重庆市卫生人才交流中心、重庆市卫生和计划生育委员会医院管理培训中心、重庆市卫生系统出国人员培训中心四块牌子，一套班子。是经卫生和计划生育委员会和重庆市机构编制委员会批准成立，重庆市卫生和计划生育委员会直属的专业化人才服务机构。中心遵循国家和本市有关法律、法规及政策规定，坚持“服务大中专医学院校、服务医疗卫生机构、服务卫生人才、服务全国卫生事业”的宗旨，本着“人尽其才，才尽其用”的原则，以市场需求和医疗卫生机构发展为导向，提供集人才中介、咨询、培训、后勤管理为一体的全方位、高层次服务，促进卫生人力资源开发、人才流动，实现卫生人才的科学配置。
