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吉林出入境检验检疫局经过多年的建设，内部管理规范严格，服务良好，作风过硬。1999年以来，局机关及全系统多次被吉林省委、省政府授予 “精神文明建设先进单位 ”、 “精神文明建设标兵单位 ”及 “精神文明建设先进系统 ”等称号。2002、2005年，局机关连续两次被中央文明委授予 “全国精神文明建设工作先进单位 ”荣誉称号。
在全省设有11个分支检验检疫机构：延边、吉林出入境检验检疫局官网珲春、通化、白城、集安、长白检验检疫局，长春机场、汽车产业开发区、临江、吉林、吉林出入境检验检疫局▲图们检验检疫办事处，并在中俄、中朝边境以及机场、铁路等重要口岸设立了口岸办事处。
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吉林出入境检验检疫局由原吉林进出口商品检验局、长春动植物检疫局和长春卫生检疫局合并组建，于1999年11月正式挂牌成立。是主管吉林省出入境卫生检疫和进出境动植物检疫，以及进出口商品检验、鉴定、认证和监督管理的行政执法机构，直属国家质量监督检验检疫总局领导。
