医院硬件设备符合三甲医院要求。拥有双源CT、西门子SENSATION 4多排螺旋CT、1.5T超导型SYMPHONY核磁共振机、DSA、多台数字化X光机，各种彩色多普勒超声仪及各种影像学检查设备；拥有开展各项腔镜手术及检查必须的多媒体设备及内镜设备；可开展心、脑血管、周围血管、肿瘤等介入治疗项目。
目前，南山医院占地面积54659.72m2，深圳市第六人民医院官网总建筑面积103288.00 m2，编制总床位900张。政府已立项拟投资13亿元，新建178000 m2的门急诊医技楼、外科大楼及行政科研教学楼，届时医院总建筑面积将达到281000 m2，床位数1300张。
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深圳市南山区人民医院（又名深圳市第六医院，简称南山医院）坐落于深圳特区西部南头半岛中心区，是深圳西部集医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合医院，也是广东医学院非直属附属医院，服务人口170万。2009年11月，医院挂牌 “华中科技大学协和深圳医院 ”，全方位开展与武汉协和医院的技术合作。
