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学校积极推动面向国家及首都经济建设与社会发展的科技工作，在应用研究、高新技术及其产业化等方面取得了可喜的成果，获奖数量位居北京市属市管院校前列，具有较强的科研和创新实力。学校大力加强师资队伍尤其是导师队伍的建设。建立了严格的硕士生导师遴选制度，不断完善导师的教书育人和科研水平评价体系，现有导师230余名，其中中国工程院院士3人，博导14名。北京工商大学研究生部官网学校严把研究生培养质量关，实行全方位全过程全要素的研究生质量管理体系，注重培养研究生科研能力和创新能力。
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北京工商大学研究生部是具体负责全校学科建设、研究生招生与学籍、研究生培养与学位、研究生管理的机构，下设学科建设管理办公室、招生与学籍管理办公室、培养与学位管理办公室、研究生管理办公室（包括就业办公室、综合办公室）部门，有13名专职工作人员，已形成了一支专业水平高、认真负责、富有效率的团队。
