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十多年来，孔子研究院坚持边建设、边开放、边研究的原则，在学术研究、学术交流和展览收藏等方面均取得了显著成果。编撰出版了 21 卷 1200 万字的《 20 世纪儒学研究大系》， 60 余卷 1200 万字的《中华__范畴丛书》前十卷和《大 哉孔子》、《中国儒学入门》等图书，孔子研究院，http://www.confucius.gov.cn，积极弘扬了以孔子及儒家思想为代表的中华民族优秀传统文化；成功申报了山东省 “孔子文化研究 ”泰山学者岗位。创办了 “春秋讲坛 ”，普及、传承儒家经典文化；先后赴澳大利亚、新西兰、欧洲八国和台湾地区举办了 “大哉孔子 ”展；与韩国国学振兴院建立了长期的学术合作关系，与韩国儒道会、日本斯文会、台湾中华孔孟学会等学术团体建立了联系，与中国人民大学孔子研究院、山东大学儒学研究中心、山东省社科院、曲阜师范大学孔子学院等开展了学术合作； 2007 年 9 月，孔子研究院成功承办世界儒学大会发起国际会议， 2008 年 9 月、2009 年 9 月召开两届世界儒学大会，并把孔子研究院设为世界儒学大会秘书处；开通了 “中国孔子研究院网 ”。相继成功举办了 “党和__人暨外国政要在曲阜 ”、 “大哉孔子 ”、 “孔府精品文物 ”、 “世界孔庙 ”、 “铜板圣迹图 ”、 “金版四书 ”、 “全国名家书画 ”等十几项展览；先后接待了一大批__人，日本、韩国、俄罗斯、奥地利、几内亚、葡萄牙、西班牙、瑞士等国家的驻华大使及部分华裔和外国友人，还有港、澳、台同胞及中外儒学届、建筑界的朋友们。
孔子研究院建设过程中，党和__人非常重视，给予多方面的关心和支持。江泽民__于 2000 年 10 月题写院名，孔子研究院，http://www.confucius.gov.cn，刘延东、吴官正、朱镕基、李铁映、叶选平、许嘉璐、丁关根、周光召、何鲁丽、陈锦华等党和__人来院亲临视察指导。谷牧__尤其关心，曾三次到现场视察和指导工作。国家有关部委也给予很大的关心和支持。山东省、济宁市的领导和有关部门也十分重视孔子研究院的建设工作。
孔子研究院工程由中国科学院院士、工程院院士、清华大学教授吴良镛先生规划设计。总体布局构图以方和圆作为基本母题，用隐喻方式充分表达中国文化内涵，孔子研究院；将儒学的 “仁 ”、 “和 ”观念融入规划之中，借鉴 “洛书 ”、 “河图 ”、 “九宫 ”格式及风水学说理论，将现有地段匠心独运、合理布局。建筑形式充分表达了孔子的文化思想内涵，体现了民族性、时代性和纪念性。
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