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苗医专科门诊也是我院特色专科之一，在州内有较高的知名度。该科博采民间苗医经验之精华，加以总结提炼，依托黔东南州丰厚的苗药资源，不仅在治疗内科、妇科一些常见病方面疗效确切，同时在治疗不孕症、结核病（肺结核、骨结核、结核性脑炎、黔东南州中医医院官网结核性心包炎）、肺癌、脑瘤、白血病、子宫肌瘤、痛经、骨髓炎等疑难病方面，也形成了独具特色的专病专方和特色制剂，具有疗效好，黔东南州中医医院▲费用低的特点，深受广大病员欢迎。
全院共有临床和医技科室26个，其中苗医呼吸内科为国家中医药管理局 “十一五 ”重点专科；苗医肛肠科、针灸科、眩晕病专科先后于2007年、2008年和2009年被列入贵州省中医药管理局重点专科建设项目；2011年，针灸科又被国家中医药管理局列为 “十二五 ”重点建设专科。苗医呼吸内科运用苗医独特的内服、贴敷、外洗等疗法，结合中医及现代医学的针灸、雾化吸入、穴位注射等诊疗各种呼吸系统疾病，尤其对肺心病、黔东南州中医医院官网，支气管哮喘、慢性咳嗽、肺结核、慢性阻塞性肺疾病等疗效满意；针灸科运用针灸、理疗、____、拨火罐、足疗、药物穴位注射等方法治疗瘫痪性疾病、三叉神经痛、肩周炎、肋间神经痛、坐骨神经痛、疱疹后神经痛、颈肩腰腿痛、腰椎间盘突出症、跌打损伤等特色明显，特别是银质针、小针刀疗法、三维正脊以及提筋治疗颈、肩、黔东南州中医医院▲，腰、腿痛等有良好疗效。苗医肛肠科继承中医、苗医传统，采取内服、熏洗坐浴、中药灌肠以及苗药膏、散的外敷等进行综合治疗，对各类大肠肛门疾病都独具特色，积累了较丰富的经验。
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黔东南州中医医院成立于1980年，目前已发展成为全州唯一的一所二级甲等中医医院，是黔东南州中医及中西医结合医疗、教学、科研中心，也是州、市医保及农合定点医疗机构。
