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除了传统的学科，如科学、法律、哲学、历史、神学和医学，洪堡大学大力发展了许多其它新兴学科。在19世纪下半叶，洪堡大学的自然学科诞生了许多伟大的学者，德国柏林洪堡大学，http://www.hu-berlin.de，如化学家霍夫曼（August Wilhelm Hofmann）；物理学家亥姆霍兹（Hermann von Helmholtz）；数学家库默尔（Ernst Eduard Kummer）、克罗内尔（Leopold Kronecker）、维尔斯特拉斯（KarlWeierstrass）；生物医学家缪勒（Johannes Peter M uuml;ller）、冯葛雷（Albrecht von Graefe）、魏尔啸（Rudolf Virchow）、柯赫（Robert Koch）等。在这段迅速发展的时期，洪堡大学逐渐合并了柏林其它一些独立的学院，比如夏丽特（Charit eacute;）医学院等。洪堡大学从建校时起就开始进行自然博物馆的建设和藏品的搜集，至今，洪堡大学自然博物馆尤为著名。
洪堡大学是依据创校者洪堡「研究教学合一」的精神所创立的新学校，他也希望洪堡大学能成为「现代大学之母」（Mutter aller modernen Universit）。德国柏林洪堡大学根据洪堡的理念，现代的大学应该是「知识的总和」(Universitas Litterarum)，教学与研究同时在大学内进行，而且学术自由，大学完全以知识及学术为最终的目的，而非实务的人才培育。
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