KIPO总部设在大田市，1998年之前设在汉城。KIPO下设5个审查部和管理支持部、管理改革与公共关系部、工业产权政策部、信息政策部、客户支持部等，设有审计监察部、知识产权裁判所(Intellectual Property Tribunal)、国际知识产权培训学院以及首尔分局等下属机构。除此之外，为解决经济困难和偏远地区人群以及中小企业等客户无力支付昂贵的专利代理费的问题，2005年4月1日，成立专利咨询中心，免费提供知识产权申请、注册以及审判等方面的咨询。
韩国知识产权局的前身是1946年成立于韩国工商部属下的专利署。1977年，更名为韩国专利管理局，转属韩国产业资源部。1988年，再次更名为韩国工业产权局。2000年6月，为了更好地反映该局的总体职能，韩国工业产权局更名为韩国知识产权局(KIPO)。2004年3月，KIPO转属科技部。
