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我院医技力量雄厚，医疗设备先进、齐全，拥有血液透析机、血滤机、震波碎石仪、全自动生化分析仪、全自动血培养分析仪、免疫化学发光仪、上海海员医院，http://www.shhyhospital.com，全自动冰冻切片机、心超、彩超、腹腔镜、电子胃肠镜、电子喉镜、前列腺电切镜、乳腺机X光机、全身螺旋CT、CR成像系统、体检车等高精尖检查设备，设有高压氧舱治疗室和上海市卫生局首批验收合格的HIV初筛实验室，上海的首例HIV阳性病例就是在我院检出。
医院设有病床450张，上海海员医院临床科室20个，医技科室7个，职工总数510人，拥有副高以上职称31人，中级以上职称144人，学科建设齐全，专科特色明显。上海海员医院开设科室有内科，伤骨科，胆道外科，妇科，骨科，肛肠科，儿科，泌尿外科，皮肤科及体检中心等科室。心内科是全国较早开展心脏起搏的科室之一，能诊治心血管系统各种疑难杂症，对难治性心力衰竭有独到的治疗经验；胆道外科由全国着名胆道外科专家施维锦教授领衔，开展各类胆道手术、微创手术、胰腺手术，特别对高龄老人的手术有丰富经验；伤骨科与瑞金医院骨科开展合作，引进国内着名的 “魏氏伤科 ”疗法，对治疗颈、肩、上海海员医院，http://www.shhyhospital.com，腰、腿痛有独到之处；中医痔外科在着名肛肠科专家蔡益芳副主任医师带领下，擅长用中西医结合疗法治疗多发性复杂性肛瘘、环状混合痔、肛管狭窄、慢性结肠炎等痔科疑难杂症；眼科有着名专家徐庆教授，擅长白内障超声乳化术、人工晶体植入术以及上睑下垂、斜视矫正术等；泌尿外科在赫赫有名的黄翼然教授和冷静副教授的担纲下，专长各类泌尿系统肿瘤、泌尿系统结石、前列腺疾病、排尿控制障碍疾病的诊断和手术治疗。有这样一支专家队伍为我院注入强大的生命活力，树立起海员医院的品牌特色，使广大病员能够以二级医院的医疗消费享受三级医院的医疗服务，真正体现了 “以病人为中心，以提高医疗服务水平为主题 ”的管理年精神，取得了良好的社会效益。
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