本局共有11个职能科室，镇江港办事处、丹阳办事处、新区办事处3个副处级办事机构，句容报检签证点、扬中报检签证点2个科技报检签证点，综合技术中心、机关服务中心、保健中心3个事业单位。镇江出入境检验检疫局，http://www.ciqzj.gov.cn，本局在编人员110人，大专以上文化程度占93%，研究生以上学历22名，具备较强的检验检疫实力和管理水平。拥有 “国家食品添加剂及调味品检测重点实验室 ”、 “江苏检验检疫车用灯具实验室 ”以及金属材料、化矿检测、艾滋病初筛等多个实验室，具备雄厚的检测实力，能够开展出入境动植物及其产品、进出口食品、轻工、纺织、镇江出入境检验检疫局服装、机电、化工、矿产石油产品、木材、纸张、水泥、纺织原料、金属材料等多种大类商品的检验检疫、鉴定及监督管理，具备对农残、药残、毒素、细菌等项目的综合检测以及口岸卫生监督、传染病监测和分类卫生处理能力。
教育，政府组织，政府，镇江出入境检验检疫局官网：http://www.ciqzj.gov.cn
