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公司的战略方针是“做大做强，创造机会求发展”，战略发展目标是以商用模块式高温气冷堆和核供热堆技术为依托，同时积极开发利用其他核应用技术，形成集工程总承包能力（工程设计、采购和建造管理能力）、市场能力和项目投融资能力于一体的核心竞争力，逐步发展成为一家国内领先、国际知名的先进核能系统供应商。
公司的核心技术——模块式高温气冷堆和核供热堆，是我国自主研发、拥有自主知识产权的先进反应堆型，中核能源科技官网这两项技术的产业化受到了国家的高度重视和大力支持： 2004年原国防科工委将高温气冷堆技术工程化研究列入科工委“十一五”规划和核工业中长期发展规划；2005年国家发__将高温气冷堆示范电厂列入可再生能源和新能源高技术产业化专项；2006年高温气冷堆核电站被列入《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006－2020年）》，成为国家重点支持的十六个重大专项之一。在1995年第八届全国人民代表大会第三次会议上的政府工作报告中，核供热堆被列为5项有代表性的取得突破性进展的科技成果之一；1996年，核供热技术被列入《中华人民共和国国民经济和社会发展“九五”计划和2010年远景目标纲要》；2006年2月，核能海水淡化技术及关键材料又被列入《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006－2020年）》相关领域的优先主题。
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中核能源科技有限公司成立于2003年8月26日，是在原国防科工委的支持和推动下，由中国核工业建设集团公司与清华控股有限公司（清华大学）共同出资组建的一家高新技术企业。2007年12月，中国广东核电集团有限公司入资中核能源科技有限公司，成为公司的第三方股东。
