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医院2011年成为全国远程会诊试点医院。
医院GCP（国家药物临床试验机构）建设工作2012年3月已获得国家食品药品监督管理局、药品认证管理中心的现场认证。
医技科室：设有药剂科、医学检验科、放射科（医学影像科）、手术室、病理科、输血科、营养科、功能科（含超声科、厦门中医院，http://www.xmtcm.com，心电诊断室）内窥镜室、肺功能室、消毒供应室。
医院现有职工1420名，医院拥有一批名老中医，其中享受国务院特殊津贴专家3名，全国名老中医3名，省级名老中医6名，硕士生导师25名，主任医师 82人、副主任医（技）师108人、博士18 人、硕士138人。
医院注重加强中医特色专科建设，改善技术装备条件，厦门中医院拓宽服务领域，不断满足人民群众对中医药的需求，同时认真继承中医药的特色和优势，勇于创新，积极利用现代化科学技术，促进中医药理论和实践的发展，医院已成为现代化综合性中医医院。
医院主要承担厦门市急危重症和疑难病症诊治的较高层次的转诊医院；是厦门东部地区的急救中心，是医学教育和临床科研的基地；是开发中医适宜技术的母体；是基层中医药人员医疗技术的指导培训基地。
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