学院采用全日制本科教育，开设了佛教英语、佛教日语两个专业，学制四年。同时面向全国寺院纲领执事以上管理人员，开设了在职佛学大专班(采取定期集中辅导与日常自学相结合的教学方式)，学制三年。2013年暑期起，学院新开设研究生班，学制二年。学院还可以根据社会需求，为佛教教职人员和佛门四众弟子开展非全日制短期培训。学院发展规划：近期(2011—2015年)，在校学僧100人;中期(2016—2020年)，在校学僧150人;远期(2021年以后)，在校学僧200人以上。
学院师资有海外归来的留学生、扬州大学教授、外籍教师以及全国知名法师教授;并聘请了多名国内著名专家学者为特聘教授和客座教授。目前与南京大学中华文化研究院、扬州大学、台湾佛光大学、日本正眼大学、加拿大湛山精舍等建立了合作交流关系，优秀毕业生可选送培养深造。
学院坚持“学修一体化、生活丛林化”办学方式;实施“以信为本、以戒为师、解行相应”的道风修持教育;注重夯实学僧文化基础、提升宗教素养知识，强化佛教英语、日语应用能力;致力培养爱国爱教、弘扬人间佛教、促进佛教文化交流的弘法僧才。
鉴真佛教学院位于全国首批历史文化名城——江苏省扬州市，坐落于国家级AAAAA级旅游区——蜀冈—瘦西湖风景名胜区内，毗邻全国重点寺院、全国重点文物保护单位、鉴真祖庭——扬州大明寺;校园占地308亩，建筑面积3.5万平方米，整体设计采用仿唐风格。学院教学设施和配套功能完善，并拥有国内一流的鉴真图书馆，是环境优雅、道风清纯、师资雄厚、特色鲜明的读书研修圣地。
鉴真佛教学院由江苏省佛教协会主办，是国家宗教局批准设立的高等佛教院校，也是全国唯一一所以培养佛教外语人才为宗旨的佛教本科院校。以“突出外语教学，注重律宗研修、弘扬鉴真精神”为办学特色。鉴真学院能“特例批准筹建”，一是由于原全国政协副主席、中国佛教协会老会长赵朴初念居士念兹在兹的遗愿，二是得到了时任国务院副总理李岚清的亲自关心，三是要打响鉴真文化品牌，宣传国家宗教政策，促进世界和平友好。
