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中心于1999年11月通过了英国劳氏ISO9001质量管理体系认证，2005年2月通过国家计量认证，2005年12月通过中国新时代认证中心国军标（GJB9001A－2001）质量管理体系认证。
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国家海洋技术中心（原海洋技术研究所）始建于1965年，是隶属于国家海洋局的公益性事业单位。中心的主要职能是负责全国海洋技术的行业管理，承担国家海洋技术发展规划、计划和标准的拟定；承担国家海洋高新技术研发及其成果的转化；承担国防建设所需的军事海洋观测技术研究和海洋技术装备及监测系统的研制与开发，并代表国家开展国际海洋技术的合作与交流，为海洋行政管理、资源开发、环境保护、国防建设和海洋科学研究提供技术支撑。
