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医院科室齐全，设有骨伤科，内科：普内科、心血管科、呼吸科、脾胃病科（消化科）、脑病科（神经内科）、内分泌科、肿瘤科、上虞市中医院，http://www.syzyy.com，肾病科、精神卫生科，外科：普外科、脑外科、泌尿外科、肿瘤外科、肛肠科，急诊科，ICU，妇科，儿科，针灸科，__科，上虞市中医院耳鼻喉科，口腔科，眼科，皮肤科，麻醉科，康复科，药剂科，检验科，病理科，输血科（血库），放射科，超声科，消毒供应室，营养科，心电图室，脑电图室，内镜室。其中，中医骨伤专科、针灸理疗康复特色专科为国家农村中医特色专科，骨伤科为浙江省中医重点专科，骨伤创伤（中西医结合）为绍兴市级重点学科，中西医结合肿瘤科为绍兴市级重点中医专科，中西医结合肿瘤科、心血管内科为绍兴市市县共建医学重点学科创建单位，骨伤科、上虞市中医院，http://www.syzyy.com，放疗科为上虞市级重点学科。肝胆外科、肿瘤外科是医院的重点学科，腔镜（微创外科）、眼科、肛肠科、不孕不育科是医院的特色专科，这批中医特色显著的重点专病专科不仅受到绍兴地区广大群众的欢迎，而且还在省内以及周边地区具有广泛的影响。
经过数代中医院人的不懈努力，医院规模不断发展壮大， 医院现占地36000平方米，建筑面积37282平方米，核定床位450张，包括1个重症监护室在内的10个病区。全院在岗职工近500人，高级职称32人，硕士研究生18人，浙江省基层名中医1名、绍兴市名医2名、上虞市中医院；绍兴市名中医1名、绍兴市青年名中医3名、上虞市名医3名。
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