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中医脑病学、中医心病学、中医肺病学、中医骨伤科学、__学、针灸学是国家中医药管理局重点学科，中医内科学、中医骨伤科学、吉林省中医院，http://www.jlhtcm.com，中医五官科学、中西医结合基础4个吉林省教育厅重点学科，中医内分泌学科、中医肛肠学科、中医康复学科、中西医结合临床学科、中医儿科学科、中西医结合基础学科、中医眼科学科7个吉林省中医药管理局重点建设学科。同时，还配备现代化大型诊疗设备，如：核磁共振、CT、吉林省中医院CR、DR、数字胃肠机、全自动生化分析仪、免疫分析仪、彩色多普勒超声诊断仪、电子纤维窥镜、多参数心脏监护系统、血液透析机、体外冲击波碎石机、微波治疗机、多普勒诊断仪、眼底氩激光仪、前列腺气化电切镜、超声聚焦刀等。
医院面积13.1万平方米，固定资产总值3.89亿元，现代化诊疗设备总值1亿元。设有病床1000张，现有职工1204人，其中高级职称232人。有享誉盛名的国家名老中医、终身教授4人，省市名医46人，博士生导师9人，硕士生导师129人。现有国家三级实验室1个、吉林省中医院，http://www.jlhtcm.com，省二级实验室3个、省卫生厅重点实验室1个；国家中医药管理局重点研究室1个、国家中医药管理局重点研究室（临床基地建设单位）1个、省级研究室13个（其中4个为省级重点研究室）。
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