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交通运输系统共有12家企事业单位。其中，事业单位6家：运管处、公路局、港口局、地方海事局、质监站和县乡公路管理局。这6个事业单位从性质上看，除港口局属全额拨款事业单位外，均为自收自支事业单位；从级别上看：港口局为副处级（领导高配），运管处、公路局、地方海事局为副处级，质监站、县乡公路局为正科级；从隶属关系看：运管处、质监站、县乡公路局的人财物等管理都在地方；港口局、公路局的人事管理、党群关系在地方，经费管理在省里；地方海事局的人事管理、经费管理在省里，党群关系在地方。交通运输企业6家：中北巴士、长运集团、长运客运公司、汽运公司、联运公司和嘉华公司。这6家交通运输企业已全部完成改制，其中，长运客运公司是由长运集团和江西长运集团分别出资49%、51%组建的股份公司。
