1987年，由陆军成建制移交给海军，改称海军安庆医院，隶属海军装备部领导，业务归口海后卫生部主要担负海军军工厂职工防病，治病，体检，疗养及卫生技术人员培训等任务海军安庆医院已发展成为一家集医疗，教学，科研，预防，保健，康复，急救，体检，疗养于一体的大中型综合性医院，医院占地面积64786㎡，医疗业务用房43456㎡，1995年被总后勤部评为第一批...是中国人民解放军第二军医大学，皖南医学院，安徽中医学院教学医院，是中国癌症研究基金会安庆肿瘤防治中心百万元以上设备20台，千万元以上设备3台，大小设备共4900多台，总价值达1.2个亿中能双光子直线加速器，模拟定位机，全身光子刀，64排128层容积CT，SPECT/CT，核磁共振，螺旋CT，大型悬吊式数字减影机（DSA），数字X光机（DR，CR），大型高压氧仓，四维彩超，超声内镜，电子内窥镜系列，电视胸（腹）腔镜，惠普中央监护系统，全自动电化学发光免疫测定系统，全自动生化分析仪，全自动微生物培养监测仪，血透机，大型肺功能测试系统等一批高，精，尖医疗设备总建筑面积20000㎡的智能化住院部大楼正式投入使用，医院整体硬件水平又上新台阶设有16个病区，42个科室，展开床位700张中华慈善总会分子靶向治疗定点合作单位，在皖西南地区处于领先地位；呼吸内科为安庆市重点学科；中医骨伤科是安徽省十二五中医重点建设专科；胸外科，消化内科等在本地享有较高声誉；骨外科，脑外科，妇产科，神经内科，放射科介入治疗室发展迅速其中高，中级职称人员，研究生200多名徐国镇，苗延浚，王肇炎教授和省内著名的骨科专家章锦教授来院工作，并与海军总医院建立了长期的业务帮带关系医疗信息基本实现计算机网络管理建筑面积3万多平米的新医疗综合楼预计2012年上半年动工建设全院人员正以饱满的工作热情积极争创三级甲等医院。
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