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与此同时，2000年至2004年，塔里木河流域管理局相继实施了六次向塔河下游绿色走廊应急输水工作，向塔河下游下泄生态水17.6亿m3，水头五次到达台特玛湖，使断流30年的塔里木河下游河道恢复了通水，下游生态环境得到初步改善，为工程治理赢得了宝贵的时间。 国家西部大开发战略的全面推进、塔河网，http://www.tahe.gov.cn，塔里木河流域近期综合治理的实施，给塔里木河流域管理局带来了千载难逢的历史机遇和挑战。塔里木河流域管理局将以科学的发展观为指导，抢抓机遇，加快发展，为创建新疆一流的流域管理机构而努力奋斗。
塔管局作为自治区水利厅派出机构，受自治区水行政主管部门的行政领导，是塔里木河流域水利委员会的办事机构，其主要职责：宣传、贯彻执行《新疆维吾尔自治区塔里木河流域水资源管理条例》等水法律法规；参与编制流域综合规划和专业规划，负责组织协调流域内水资源的调查评价和科学考察，制定水的中长期供求计划和水量分配方案；负责在塔里木河干流河道管理范围内组织实施取水许可制度，征收水资源费、塔河网水土流失防治费、水土保持设施补偿费等；负责塔里木河干流区河道及源流区重要河段河道的规划、整治、建设和保护；负责塔里木河干流及直属工程的防洪抗旱的调度工作；负责流域综合治理与开发，组织建设、管理干流的河道水工程；负责预审流域内各源流扩建、改建、加固水工程、主要节水工程的规划设计和科研实验工作；负责流域内的计划用水、节约用水、灌溉管理工作；负责编制并实施干流水土保持规划；负责干流和源流主要供水的水量、水质、水土流失监测与控制；负责制定包括源流和干流重要控制性分水工程在内的用水调度管理办法；汇总流域内各地、州水利年度投资计划，审查流域内水工程项目的建设，并报自治区水行政主管部门审批，批准后负责监督实施；负责向常委会呈交年度工作报告和规划、计划、项目、预算等方面的报告以及需由常委会决定的其他事项的报告，经执委会办公室审查后报常委会。
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