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目前医疗门诊部开设“针灸科”、“__科”、“中医内科”和“康复科”，以及“特需门诊”，为“上海市城镇职工基本医疗保险定点医疗机构”、“中国上海国际针灸培训中心临床实习基地”。近年来针研所对免疫、内分泌、神经、运动、心血管、上海市针灸经络研究所官网消化、泌尿、__等系统疾病的针灸疗效机制进行深入研究。对针刺治疗某些免疫性、内分泌性疾病和各种疼痛性疾病有明显效果。临床上逐步形成以针灸为主结合中西药、现代针灸仪器等综合手段治疗中风后遗症、溃疡性结肠炎、慢性排尿障碍（尿道综合症、上海市针灸经络研究所▲尿失禁）、耳鸣耳聋、肠易激综合征、帕金森氏病、震颤麻痹、脑萎缩、颈腰椎病、肥胖症等的业务特色。
针研所在针灸流派的传承、挖掘、研究方面也做出了不懈努力，是上海市针灸学术流派传承研究中心。“陆氏针灸疗法”，2009年被列为“上海市非物质文化遗产名录项目”，2010年被列为”国家级非物质文化遗产名录推荐项目。上海市针灸经络研究所官网，针研所是承担针灸博士、硕士研究人才的培养机构，已培养针灸学博士50余名，硕士100余名，出站博士后5名。同时，是中国针灸学会实验分会、上海针灸学会针法灸法专业委员会、文献专业委员会、实验针灸专业委员会__单位。承办了《上海针灸杂志》、《针灸__医学》（英文版）杂志。
针研所，历经几代人传承创新，现是针灸__学国家重点（培育）学科建设单位、国家973计划项目首席科学家单位、上海市针灸__学重点学科带头人单位和建设单位，具有一支在临床、教学、科研等方面能力较强的针灸专业技术队伍。拥有国家中医药管理局针灸免疫效应重点研究室，3个国家中医药管理局三级实验室（针灸免疫实验室、上海市针灸经络研究所▲，针灸分子生物学实验室和脑神经生物实验室），1名上海市名中医、2个“名中医工作室”，1个上海市特色专科和2个上海中医药大学特色专科。
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上海市针灸经络研究所的前身是上海市针灸研究所（1958年成立）和上海市经络研究所（1964年成立）。1971年针灸研究所、龙华医院、经络研究所合并成立上海市中医研究所。1980年上海市针灸经络研究所恢复成立。2002年为了促进科研与临床的紧密结合，上海市针灸经络研究所与岳阳医院合并。
