在馆务多功能性的思考下，除了教育，学术，保育层面的提升外，国立海洋生物博物馆亦朝向社区性，娱乐性，国际性等全方位的领域拓展；同年七月，馆中之水族馆部门，在甄选后委由海景世界企业股份有限公司负责专业经营管理不仅开创国立社教单位首宗委外经营的案例，更彻底落实专业分工的合作理念珊瑚王国馆开幕之后，结合水族馆及全数位影像化的方式，介绍涵盖全球水域，古海洋的世界水域馆，透过先端科技的整合展示古代海洋，海藻森林，深海水域，极地水域等四大主题达到寓教于乐的参观体验并将为中华民国在跨世纪的海洋教育，研究，展示方面，写下最耀眼的一章西临蔚蓝的台湾海峡，东傍72公尺高的龟山，全区规划面积合计为96.81公顷，其中博物馆区规划兴建 35.81 公顷，而周边绿地与服务设施区（如停车场，游客服务中心）则占地60余公顷珊瑚王国，世界水域三大主题展示馆，行 政与教学中心，由一共同大厅串连而成），水族实验中心，服务设施，研究大楼，维护设施，国际会议中心以及学研中心等数个主要建筑区整体规划理念主要以展现水的精神与特性为主，以低密度的建筑开发，分散机能相异的建筑物并以步道相连接，维持了与原有自然环境的和谐关系有大翅鲸偕幼鲸跃出水面，抹香鲸露头喷水换气，游客可在此消暑戏水，感受鲸类的巨大身驱和淋淋的水意设立的目的主要提供短期主题式，专门性之特别展出水的义涵为设计理念，将造型景观的语汇藉由海浪的斜型屋顶，自然地融入潮间带的生态公园中提供展示功能〈垦丁国家公园展示区〉，谘询服务，购票验票，购物餐饮，休憩等等迎面可见屋顶悬吊的海豚，大章鱼，鲸鲨，杀人鲸等逼真模型，另有高耸的瀑布和精致的铜雕，大厅前后方皆设计为大片帷幕玻璃墙，可眺望晨曦与夕照之美，是兼具科学知性与艺术价值的空间展示国内户外首见超大型琉璃作品，命名为爱与新生，是由闻名国际的琉璃工房创作；以黑色镜面大理石为基础，由琉璃缕刻，可发光的轴孔珊瑚结合而成的蛋型雕塑，象征台湾海洋环境，正以新生之姿，散发光与热本区设施都是海洋生物造型，提供儿童休憩与游戏的场所，鼓励儿童透过富于想像力与创造力的游戏探索海洋世界之奥祕挑战困难的施作技术，与充分掌控优良工程品质的海生馆工程，在两千多件参赛作品中脱颖而出，获得美国工程顾问协会颁发的美国2001杰出工程奖首奖，是对海生馆的鼓励，亦是国人共享的殊荣，更为国内公共工程品质立下了新的里程碑16.5公尺宽，0.33公尺厚的巨型尺寸，展示台湾东部海域鱼群洄游的大洋池，除承受100万加仑水压，亦可承受0.97G的震动安全系数，防火系数为三级与97%透光，为海生馆工程重点之一有完整的监控系统及复杂相关的管路设施，维生系统是水族生物的活力泉源，亦是维持营运的重要设施长达81公尺的海底景观展示动线，为全亚洲最大的海底隧道，提供了身历其境的潜水之旅。
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