自治区教育厅（高校工委）内设21个职能处室，分别为：办公室（高校工委办公室）、人事处（高校工委组织部）、发展规划处、政策法规处、财务处、基础教育处、职业教育与__教育处、高等教育处、内蒙古教育，http://www.nmgov.edu.cn，民族教育处、师资管理处、督导室（自治区人民政府教育督导团办公室）、思想__与学生工作处（高校工委思想__与学生工作部）、科学技术处、对外合作与交流处、体育卫生与艺术教育处、汉语言文字应用管理处（汉语言文字工作委员会办公室）、学位管理与研究生教育处（自治区学位委员会办公室）、民办教育管理处（高校工委民办高校党务工作部）、监察审计处（高校纪工委）、机关党委、离退休人员工作处。
（十六）承办自治区党委和人民政府交办的其他事项。
(十四)贯彻落实国家语言文字工作的方针、内蒙古教育政策，编制自治区汉语言文字工作的中长期规划；协调指导和监督检查部门、行业的汉语言文字工作；指导推广普通话和普通话师资培训工作。
(十二)规划并指导高等学校自然科学和哲学、社会科学研究，指导高等学校的科学技术应用研究与推广、科研成果转化和 “产学研 ”结合工作；协调、指导高等学校承担国家和自治区重大科研项目的实施和教育信息化建设工作；指导高等学校所设的国家和自治区重点实验室、工程研究中心、人文社会科学重点研究基地和图书馆建设。
(十)主管全区教师工作，指导各级各类学校教师、中小学校长和教育行政干部队伍的建设工作；指导并组织教师资格制度和教师继续教育工作；会同有关部门提出各级各类学校教职工编制标准。
(八)负责本部门教育经费的统筹管理，参与拟订教育经费筹措、教育拨款、教育基建投资的政策；监测教育经费的使用情况；负责统计全区教育经费投入情况。
（六）指导并负责高等教育、民办高等学历教育发展与改革，负责高等学校专业设置、调整工作和教育教学管理；指导教材建设、教育技术装备和信息化建设工作；负责高等学校办学水平和教育质量的监督、检查、评估工作和学籍学历管理工作；指导和管理高等学校学科建设、学位及研究生教育工作。
（四）指导并组织教育督导工作，负责对中等及中等以下教育、扫除青壮年文盲工作的督导评估和检查验收工作，组织开展基础教育发展水平和质量监测工作，发布教育督导报告。
（二）负责各级各类教育的统筹规划和协调管理，会同有关部门研究制订中等、内蒙古教育，http://www.nmgov.edu.cn，初等教育各类学校的设置标准，指导各级各类学校的教育教学改革。
内蒙古自治区教育厅为自治区人民政府组成部门。__内蒙古自治区高等学校工作委员会为自治区党委的派出机构，与自治区教育厅一个机构两块牌子。
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