进入新世纪的淮安生物工程高等职业学校环境面貌日新月异，各项事业发展迅猛。因成绩突出，先后荣获 “全国教育系统先进集体 ” “江苏省大中专学生社会实践活动先进集体 ” “江苏省首届创新大赛优秀学校 ” “淮安市高校毕业生就业工作先进集体 ” “淮安市招生工作先进单位 ” “淮安市实施富民育农工程先进集体 ” “淮安市预防青少年违法__先进集体 ” “淮安市文明单位 ”等多项荣誉称号。当前，全校上下正与时俱进，开拓创新，真抓实干，为培养高素质的应用型人才，积极推进地方经济发展而努力奋斗。
学校十分重视毕业生安置工作，负责对所有毕业生推荐就业岗位。淮安生物工程高等职业学校官网专设毕业生就业指导中心，并在昆山和上海设立办事处，与北京、上海、南京、苏州、无锡、昆山和常州等数百家知名企业建立长期合作关系。近年与日本等国家建立合作业务，淮安生物工程高等职业学校▲推荐优秀毕业生出国学习深造。2005年以来有6批学生赴日本研修。目前学校当年内就业率一直保持在98％以上，对口就业率在85％以上。
学校现有教师中中高级职称占73％，双师型专任教师占61.4％。近年来，有40多位教师主持或参与了多项科研项目，有20多项获得市级以上的科研成果奖；有30多位教师在国家、省、市学术团体任理事以上职务，教师主编、参编教材50多种，有多人赴日本、欧洲考察进修。
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我校是一所以五年制大专为主、三年制中专为辅的国家级重点学校。创建于1908年，前身为江苏省淮阴农业学校，2003年升格为高等职业学校，定名为淮安生物工程高等职业学校、江苏联合学院淮安生物工程分院，为全国教育系统先进集体、江苏省技能型紧缺人才培养培训基地、淮安市赴日本研修生派遣基地。
