60年代以来先后形成肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、创伤外科、血液内科、消化内科等特色学科。目前拥有国家级重点学科15个，全军专科研究所、中心13个，全军重点实验室2个，上海市临床医学中心2个，第二军医大学附属上海长海医院官网上海市医学质控中心3个，上海市示范学科1个，现为全军、全国临床药理基地。部分研究项目具有国际先进水平。医院注重高新技术的创新和运用，在脑血管病防治、血管外科、影像诊断、第二军医大学附属上海长海医院▲X线刀、微波治疗、腹腔镜手术、“细胞刀”治疗帕金森病、整形整容、准分子激光近视手术、钬激光治疗泌尿系结石、肛肠疾病诊治、放射治疗、介入治疗、基因治疗、创伤救治、房间隔缺损封堵、颈椎脊柱病诊治、第二军医大学附属上海长海医院官网，中晚期肝癌的中西医结合治疗及血液净化等方面各展所长，形成了新的特色。
医院设备先进，拥有正电子发射计算机断层显像设备（PET）、超高档螺旋CT3台、核磁共振（MRI）3台、数字减影仪（DSA）4台、核素扫描仪（ECT）、直线加速器、高压氧舱、准分子激光治疗仪、激光手术刀、全自动生化分析仪及重症监护系统等现代化诊疗设备。医院特色明显，60年代以来先后形成肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、创伤外科、血液内科、消化内科等特色学科。目前拥有国家级重点学科15个，全军专科研究所、第二军医大学附属上海长海医院▲，中心13个，全军重点实验室2个，上海市临床医学中心2个，上海市医学质控中心3个，上海市示范学科1个，现为全军、全国临床药理基地。部分研究项目具有国际先进水平。医院注重高新技术的创新和运用，在脑血管病防治、血管外科、影像诊断、X线刀、第二军医大学附属上海长海医院官网微波治疗、腹腔镜手术、“细胞刀”治疗帕金森病、整形整容、准分子激光近视手术、钬激光治疗泌尿系结石、肛肠疾病诊治、放射治疗、介入治疗、基因治疗、创伤救治、房间隔缺损封堵、颈椎脊柱病诊治、中晚期肝癌的中西医结合治疗及血液净化等方面各展所长，形成了新的特色。2008年，第二军医大学附属上海长海医院▲全院门急诊量突破170万人次，出院病人5.3万人次，完成手术2.6万例次。医护质量稳步提高，发表论文、中标科研基金和科研成果历年来保持全国各大医院领先水平。创办了《中华胰腺病杂志》和《药学服务与研究》两本期刊。
第二军医大学第一附属医院长海医院创建于1949年7月14日，建院以来，医院名称随着学校名称变化而改变。1949年5月30日，上海市军事管制委员 会任命向进--为接管国民党联勤第二总院接管专员。并于7月14日正式成立了华东军医人民医学院附属医院；1950年11月医院改名为上海军医大学医院； 1951年7月改称为第二军医大学附属医院；1958年9月，因学校组建第二附属医院，故定名为第二军医大学第一附属医院；1962年7月对外称谓上海长 海医院。1953年4月以前，医院建制隶属于华东军区后勤卫生部。第二军医大学附属上海长海医院官网；从1955年起执行师级权限。1969年9月调防西安，1975年7月迁回上海。
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