学校现有附属协和医院、附属第一医院、附属第二医院、附属口腔医院4所附属医院，附属第三医院正在建设中，同时在福建省设有省立临床医学院（省立医院）、福总临床医学院（南京军区福州总医院）、附属漳州市医院、附属泉州第一医院、附属三明第一医院、附属龙岩第一医院、福建医科大学官网附属传染病医院、附属闽东医院、附属南平第一医院等非直属附属医院(含临床医学院)9所。此外，有临床教学医院29所，形成了比较完善的临床教学与实践教学基地网络，有效保障了临床实践教学的需要。
学校现有基础医学院、公共卫生学院、医学技术与工程学院、福建医科大学▲药学院、护理学院、人文学院、外国语学院、协和临床医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、口腔医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、思想__理论课教学研究部和体育教学研究部、研究生教育学院、海外教育学院、__教育学院、福建医科大学官网，继续教育学院、职业技术学院等20个学院（部）；有临床医学（七年制）、临床医学（五年制）、口腔医学、医学检验、麻醉学、医学影像学、康复治疗学、预防医学、护理学、药学、药物制剂、应用心理学、英语、社会工作、公共事业管理等24个本科专业（方向）；有基础医学和临床医学2个一级学科博士点、二级学科博士点27个，一级学科硕士点8个、二级学科硕士点54个，硕士专业学位授权点5个。目前有各类在校生23000多人，福建医科大学▲，其中全日制的本科生12000多人、博士研究生230多人、硕士研究生2200多人，本科专业面向全国招生，并招收港澳台侨生和外国留学生。此外，学校已形成了多学科、多层次的__医学教育办学体系。
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福建医科大学创建于1937年，经过70多年的建设发展，学校已形成学士 mdash;硕士 mdash;博士人才培养体系和 “勤奋、严谨、求实、创新 ”优良校风，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。2003年，被福建省人民政府确定为重点建设高校。
