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本院现有在编职工132人，其中专业技术人员占全所职工总数的80%以上，博士学位和硕士学位拥有者约占专业技术人员的50%。内部机构设有办公室、人事教育科、业务科、质量管理科、科研管理科等职能科室和化学药品室、中药室、浙江省食品药品检验所，http://www.zjyj.org.cn，抗生素室、药品包装材料室、药理室、保健食品化妆品（食品）室等检验科室，科室内设实验动物中心、中药标本室、图书室、档案室、会计室和电脑室。实验室拥有液质联用仪、气质联用仪、电感耦合等离子体质谱仪，配有各类检测器的高效液相色谱仪和气相色谱仪、浙江省食品药品检验所红外分光光度计、近红外分光光度计、原子吸收分光光度计、双道原子荧光光度计、荧光分光光度计、薄层色谱扫描仪、血液分析仪、全自动生化分析仪、微波消解仪、CO2超临界提取仪、气体透过测定仪、应力测定仪等400余台先进仪器设备。现有办公、实验用房7000多平方米。
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