全系统编制总人数279名，其中：行政编制96名，事业编制181名，行政附属编制2名。2013年12月31日，局机关和事业单位111人，9个镇财政所(分局)124人，实有235名在职干部。
3、在9个镇设立财政所(分局)，均为副科级建制。
2、下属7个事业单位：市财政稽查大队(副科级)、市融资办(协税护税办)(副科级)、市财政票据管理所、市财政支付中心、市财会教育中心(江苏省中华会计函校常熟分校)、市财政投资评审中心(副科级)、市基层财政服务中心。
1、财政局内设14个职能科室，分别是办公室、人教科、预算科(税政法规科、行政许可服务科)、经济建设科、农财科、综合科、教科文和行政政法科、监督检查科、社会保障科、政府采购管理科、绩效管理科(行政事业资产管理科)、国库科、工贸发展科(金融科)、会计科。市国资办内设2个职能科室。分别是产权管理科、考核监督科。
常熟市财政局前身为常熟县财税局，初建于1970年11月，1981年7月改称为县财政局;1983年3月，常熟撤县建市，政府序列部门进行调整，设置市财政局;1984年1月，财税分设，分别行使职能。2010年5月27日，常政办发[2010]68号《常熟市财政局、常熟市政府国有资产监督管理办公室主要职责内设机构和人员编制规定》，市财政局、市国资办是市政府主管财政收支、财税政策、国有资本金管理等工作的职能部门。
