图书馆现设有图书馆与资讯科学研究所、医学情报研究所和中国古文献研究所。自1996年以来，医学情报研究所内部编辑出版《医学信息荟萃》旬刊。中山大学图书馆始终注重馆员专业素质的培养和科研水平的提升，承担了多个科研项目的研究工作，在图书馆学、文献学、古籍整理与数字化等领域取得了丰硕的成果。中山大学文书馆，http://library.sysu.edu.cn，目前图书馆承担的大型科研项目包括由美国岭南基金会资助的 “中山大学图书馆馆藏碑帖数字化 ”项目、教育部CALIS特色数据库项目 “大珠江三角州研究数据库 ”等。
中山大学图书馆现已完成局域网的全面升级改造，建成主干为千兆，百兆到桌面的高速局域网。在全校四个校区图书馆以及三个学科分馆中使用统一的图书馆自动化管理系统，建立了无缝连结，形成了便利的分布式数字化信息服务网络，实现了数据资源的共建、共知与共享，及图书资料通借通还。
中山大学图书馆拥有丰富的文献信息资源。经过数十年的建设与发展，中山大学图书馆已逐步建立起文、理、中山大学文书馆医学科门类齐全、内容丰富、结构合理、层次分明的文献信息资源保障体系。截止到2008年12月，中山大学图书馆纸质馆藏总量达535.708万册(件)，其中，古籍图书近40万册；中文纸本期刊4495种；外文纸本期刊1326种；年新书刊资料增长量为21余万件。中文电子期刊24025种；外文电子期刊24132种；中文电子图书91.117万册；外文电子图书31.220万多册；光盘及网络数据库300多种；多媒体光盘资源4.16万片。
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