(十二)对各种经济成份的企业实行宏观管理和指导，规范企业行为；协调解决企业改革中的重大问题；指导现代企业制度建立；协调企业重大资产重组项目；指导企业加强管理，推进企业管理现代化。指导企业内部法律顾问工作；指导和组织经济管理干部和企业管理人员的培训，指导企业智力引进工作。
(十)研究拟订工商领域利用外资的有关政策，指导工商企业利用外资工作；负责编制并组织实施商业利用外资试点项目的规划；负责工业制成品进出口动态监测；负责大宗重要工业品的进出口管理工作；指导生产企业的自营进出口工作；指导外商投资企业产品配套协作。负责组织协调反倾销、反补贴和保障措施工作，建立产业损害预警机制，组织产业损害调查。
(八)研究和规划竞争性行业的投资布局，指导工商企业、南通市经济贸易委员会官网金融机构及社会资金的投资方向；负责工商企业技术改造投资项目的管理；会同有关部门对上市企业的募集资金投向进行监督；提出鼓励企业技术改造的有关政策并组织实施；对国家、省和市支持的重点技术改造投资项目进行监督检查。
(六)制定贯彻国家产业政策的实施意见；指导全市工商业结构调整和升级；研究提出产业发展方向、重点行业发展的政策措施；提出优化产业结构、所有制结构和企业组织结构的政策建议；联系和指导全市工商领域有关行业协会及其他社会中介组织的工作。
(四)研究提出推进新型工业化发展的意见、思路；研究拟订推进企业技术创新、产业技术进步、高新技术产业化和信息化带动工业化的政策措施，并组织实施；指导和推动以企业为主体的技术创新体系建设，促进产学研联合；组织推进重点技术创新工作和重大技术装备国产化项目的实施；负责归口的科技专项经费和项目管理；指导工商企业质量管理，南通市经济贸易委员会▲组织企业实施名牌战略。
(二)编制并组织实施经济运行调控目标、政策措施，监测、分析全市经济运行态势；会同有关部门引导和调节经济运行，协调解决经济运行中的矛盾和问题；组织指导全市工业企业扭亏增盈工作；负责综合交通的协调工作；组织推进全市现代物流业的发展。
根据以上职能调整，市经贸委(市乡镇企业管理局、市中小企业局)的主要职责是：
2．将经济技术协作的管理职能交给市发展和改革委员会。
划出的职能
南通市经济贸易委员会官网，教育，政府组织，地方政府网站。
根据《__南通市委、南通市人民政府关于市级政府机构改革的实施意见》(通委发(2005)2号)，保留南通市经济贸易委员会(以下简称市经贸委)，为南通市人民政府工作部门，对__ 南通市乡镇企业管理局 和 南通市中小企业局 的牌子。南通市经贸委是市政府负责调节全市近期国民经济运行的综合经济部门。
