学校现有临床医学和基础医学2个博士后科研流动站，科研机构71个，国家重点培育学科1个，卫生部临床重点专科3个，省 “211工程 ”重点学科2个，省教育厅重点学科13个，省科技厅优先发展学科8个，教育部重点实验室1个，省重点实验室1个，福建医科大学，http://www.fjmu.edu.cn，省部共建重点实验室2个，省教育厅重点实验室5个，承担着大量的科研任务，成果显著。学校编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》等，面向国内外公开发行。学校图书馆面积近2.3万平方米，图书、资料200多万册，是福建省医学图书中心馆。
学校现有教职医护员工5279人（含附属医院），其中校本部912人。福建医科大学在1228名专任教师中，具有研究生学位占64.58 %，高级职称占71.01%。博士生导师80名，硕士生导师524名。国家 “千人计划 ”人选1人，国家有突出贡献中青年专家4人， “新世纪百千万人才工程 ”国家级人选6人，教育部新世纪优秀人才支持计划1人，卫生部有突出贡献中青年专家5人，教育部优秀青年教师资助3人，教育部骨干教师资助8人，享受国务院特殊津贴专家105人，福建省优秀专家23人， “福建省百千万人才工程 ”人选 62人，福建省高校教学名师13人，福建省高校新世纪优秀人才支持计划人选33人，福建省高校创新团队2个。
学校现有上街、台江2个校区，占地1300余亩，校舍建筑面积近40万平方米。学校被评为 “全国教育系统抗震救灾先进集体 ”、福建省党建和思想__工作先进高校、省文明学校、省 “依法治校 ”示范校、省 “校务公开 ”示范校、福建医科大学，http://www.fjmu.edu.cn，省计划生育先进单位、省卫生先进单位、省绿化模范单位和省级花园式单位等荣誉称号。
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