澳门海事及水务局主要职能包括确保海事安全,监管和控制航海活动;统筹海上事故搜救行动;发出从事海事及港口活动的准照;统筹和监察港口事务,确保港口活动符合安全规定;统筹和管理客运码头的运作;促进发展与渔业有关的活动;统筹供水事务,研究和制定水资源管理的政策、制度及措施等。
澳门海事及水务局于2013年7月18日由港务局改组而成,隶属澳门特别行政区政府运输工务司,乃具行政自治权的公共部门,负责行使海事当局权力、促进发展海事活动、协调管理水资源,务求令市民、旅客以及相关业界享有优质的海事和供水服务。