市防指办主要职责：贯彻执行国家、省有关防汛防旱工作法规、方针、政策，执行市防指的各项决策和上级防汛防旱指挥部的调度指挥。编制修订全市防汛防旱预案和重要江河洪水调度方案、抗旱应急供水方案。指导和组织开展洪涝台灾害的各项防御准备工作。掌握雨情、金华防汛网，http://www.jhfx.gov.cn，水情、工情及防汛防旱动态，编制汛情、旱情通告。检查督促、协调联络有关部门、单位做好防汛防旱工程设施和水毁工程的修复及有关防汛防旱工作。负责编制本级防汛防旱日常工作和应急处置经费预算。做好有关洪涝台旱灾情统计、核查、上报、总结评估。组织指导全市防汛防旱物资的储备、金华防汛网管理和调用工作。负责市防指的日常管理事务，负责市防指交办的其他工作。
市防指主要职责：组织制订完善防汛防旱各类应急预案，审定和批准重要江河洪水调度方案、重要水库控运计划、抗旱应急供水方案，以及有关规定、规程、办法等。组织开展防汛防旱检查，督促有关部门、单位及时处理影响防汛防旱安全的有关问题。负责重要江河、水库等洪水调度，抗旱应急供水调度；贯彻执行上级防汛抗旱调度命令和批准的洪水调度方案、抗旱应急供水方案。负责发布全市汛情、旱情通告，以及发布和解除紧急防汛期、非常抗旱期。组织灾后处置，并做好有关协调工作。
金华市政府设立防汛防旱指挥部（以下简称市防指），负责领导组织全市的防汛防旱工作。市防指指挥由市政府分管副市长担任，副指挥由市委分管副秘书长、市政府分管副秘书长、金华防汛网，http://www.jhfx.gov.cn，市水利局局长、金华军分区参谋长、市水利局分管副局长担任。
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