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为进一步提高模型研发效率和拓展技术服务领域，中心不断加大新技术研发力度，成功建立了高效基因同源重组、四倍体囊胚补偿、细菌人工染色体（BAC）和组织细胞特异性诱导表达的转基因、条件性基因剔除和基因“敲入”、胚胎冷冻保存复苏等遗传工程小鼠模型研发技术。现已形成以小鼠转基因或基因剔除技术为核心，以疾病动物模型表型分析检测、仪器设备共享、开放实验室及动物实验环境条件保障、上海南方模式生物研究中心官网疾病动物模型资源共享平台为支撑的模式生物技术研发公共服务平台。中心成立至今，通过自主研发或合作研究，累计建立了300余种具有自主知识产权的遗传工程小鼠模型；累计发表科研论文89篇；获得新技术发明专利18项；为上海市和国内高校、科研院所及生物医药研发企业提供260项模式生物技术服务；为国家重大基础性研究项目、863项目、中科院“知识创新”工程、国家自然科学基金项目、上海市科研项目及企业新药研发项目的顺利实施提供了关键的疾病动物模型研发技术或资源的保障支撑，上海南方模式生物研究中心▲为我国基础生物学研究及生物医药产业发展做出了重要贡献。
中心坚持以专业技术人才为核心，以模式生物关键技术为龙头的发展思路，聚集了一批学术造诣深、技术精湛的科研技术人才，建立了从基因克隆、转基因或基因剔除质粒构建到小鼠胚胎干细胞操作、显微注射、遗传育种、基因型鉴定、品系繁育、表型分析检测、胚胎冻存等一系列遗传工程小鼠模型研发技术，实现了从目标基因到转基因或基因剔除小鼠模型的流水线研发模式，使模型研发能力达到每年产出100-150种各类转基因或基因剔除小鼠模型的规模。
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上海南方模式生物研究中心是国家科技部863计划生物技术领域“疾病动物模型研发基地”和“上海模式生物研发基地”之一。自2001年成立以来，在上海市科委组织领导下，中心联合沪上多家从事相关研究的高校、科研院所及生物医药研发企业，在国内率先建成规模化遗传工程小鼠（疾病动物）模型研发技术平台，其研发效率和规模达到国内一流、国际先进的水平。
